索引 _ | A | B | C | D | E | F | G | H | I | K | L | M | N | O | P | Q | R | S | T | U | V | W | Z _ __init__() （omicverse.bulk.Deconvolution 方法） __init__() （omicverse.bulk.pyDEG 方法） __init__() （omicverse.bulk.pyGSEA 方法） __init__() （omicverse.bulk.pyPPI 方法） __init__() （omicverse.bulk.pyTCGA 方法） __init__() （omicverse.bulk.pyWGCNA 方法） __init__() （omicverse.bulk2single.Bulk2Single 方法） __init__() （omicverse.bulk2single.BulkTrajBlend 方法） __init__() （omicverse.bulk2single.Single2Spatial 方法） __init__() （omicverse.metabol.pyMetabo 方法） __init__() （omicverse.micro.Alpha 方法） __init__() （omicverse.micro.Beta 方法） __init__() （omicverse.micro.DA 方法） __init__() （omicverse.micro.MMvec 方法） __init__() （omicverse.micro.Ordinate 方法） __init__() （omicverse.pl.CellChatViz 方法） __init__() （omicverse.pl.ForbiddenCity 方法） __init__() （omicverse.pl.geneset_wordcloud 方法） __init__() （omicverse.single.Annotation 方法） __init__() （omicverse.single.AnnotationRef 方法） __init__() （omicverse.single.CellOntologyMapper 方法） __init__() （omicverse.single.CellVote 方法） __init__() （omicverse.single.cNMF 方法） __init__() （omicverse.single.DCT 方法） __init__() （omicverse.single.DEG 方法） __init__() （omicverse.single.Drug_Response 方法） __init__() （omicverse.single.Fate 方法） __init__() （omicverse.single.gene_trends 方法） __init__() （omicverse.single.GLUE_pair 方法） __init__() （omicverse.single.MetaCell 方法） __init__() （omicverse.single.MetaTiME 方法） __init__() （omicverse.single.Monocle 方法） __init__() （omicverse.single.pyCEFCON 方法） __init__() （omicverse.single.pyMOFA 方法） __init__() （omicverse.single.pyMOFAART 方法） __init__() （omicverse.single.pySCSA 方法） __init__() （omicverse.single.pySIMBA 方法） __init__() （omicverse.single.pyTOSICA 方法） __init__() （omicverse.single.pyVIA 方法） __init__() （omicverse.single.SCENIC 方法） __init__() （omicverse.single.TrajInfer 方法） __init__() （omicverse.single.Velo 方法） __init__() （omicverse.space.CellLoc 方法） __init__() （omicverse.space.CellMap 方法） __init__() （omicverse.space.Deconvolution 方法） __init__() （omicverse.space.GASTON 方法） __init__() （omicverse.space.pySpaceFlow 方法） __init__() （omicverse.space.pySTAGATE 方法） __init__() （omicverse.space.pySTAligner 方法） __init__() （omicverse.space.STT 方法） __init__() （omicverse.space.Tangram 方法） __init__() （omicverse.utils.LDA_topic 方法） A adata（omicverse.single.Monocle 属性） add_density_contour()（在 omicverse.pl 模块中） add_palue()（在 omicverse.pl 模块中） add_pie2spatial()（在 omicverse.pl 模块中） add_streamplot()（在 omicverse.pl 模块中） aggregate_by_class()（在 omicverse.metabol 模块中） Alpha（omicverse.micro 中的类） amplicon_16s_pipeline()（在 omicverse.alignment 模块中） anndata_to_CPU()（在 omicverse.pp 模块中） anndata_to_GPU()（在 omicverse.pp 模块中） annotate_lipids()（在 omicverse.metabol 模块中） annotate_peaks()（在 omicverse.metabol 模块中） AnnotationRef（omicverse.single 中的类） Annotation（omicverse.single 中的类） anova()（在 omicverse.metabol 模块中） asca()（在 omicverse.metabol 模块中） asca_variance_bar()（在 omicverse.metabol 模块中） attach_tree()（在 omicverse.micro 模块中） auto_resolution()（在 omicverse.single 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模块中） pbmc8k()（在 omicverse.datasets 模块中） pca()（在 omicverse.pp 模块中） plot1cell()（在 omicverse.pl 模块中） plot_cellproportion()（在 omicverse.pl 模块中） plot_ConvexHull()（在 omicverse.pl 模块中） plot_embedding_biplot()（在 omicverse.micro 模块中） plot_embedding_celltype()（在 omicverse.pl 模块中） plot_flowsig_network()（在 omicverse.pl 模块中） plot_grouped_fractions()（在 omicverse.pl 模块中） plot_metacells()（在 omicverse.single 模块中） plot_mmvec_training()（在 omicverse.micro 模块中） plot_paga()（在 omicverse.utils 模块中） plot_pca_variance_ratio()（在 omicverse.pl 模块中） plot_set()（在 omicverse.pl 模块中） plot_spatial()（在 omicverse.pl 模块中） plot_text_set()（在 omicverse.pl 模块中） plsda()（在 omicverse.metabol 模块中） prefetch()（在 omicverse.alignment 模块中） preprocess()（在 omicverse.pp 模块中） pyCEFCON（omicverse.single 中的类） pyDEG（omicverse.bulk 中的类） pyGSEA（omicverse.bulk 中的类） pyMetabo（omicverse.metabol 中的类） pyMOFAART（omicverse.single 中的类） pyMOFA（omicverse.single 中的类） pyPPI（omicverse.bulk 中的类） pySCSA（omicverse.single 中的类） pySIMBA（omicverse.single 中的类） 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omicverse.io 模块中） read_csv()（在 omicverse.io 模块中） read_h5ad()（在 omicverse.io 模块中） read_lcms()（在 omicverse.metabol 模块中） read_metaboanalyst()（在 omicverse.metabol 模块中） read_nanostring()（在 omicverse.io 模块中） read_visium()（在 omicverse.io.spatial 模块中） read_visium_10x()（在 omicverse.space 模块中） read_visium_hd()（在 omicverse.io 模块中） read_visium_hd_bin()（在 omicverse.io 模块中） read_visium_hd_seg()（在 omicverse.io 模块中） read_wide()（在 omicverse.metabol 模块中） read_xenium()（在 omicverse.io 模块中） readWGCNA()（在 omicverse.bulk 模块中） recover_counts()（在 omicverse.pp 模块中） ref()（在 omicverse.alignment 模块中） refine_label()（在 omicverse.utils 模块中） regress()（在 omicverse.pp 模块中） regress_and_scale()（在 omicverse.pp 模块中） remove_cc_genes()（在 omicverse.pp 模块中） retrieve_layers()（在 omicverse.utils 模块中） roc_feature()（在 omicverse.metabol 模块中） roe()（在 omicverse.utils 模块中） rotate_space_visium()（在 omicverse.space 模块中） run_cellphonedb_v5()（在 omicverse.single 模块中） run_liana()（在 omicverse.single 模块中） run_mofa()（在 omicverse.metabol 模块中） S s_plot()（在 omicverse.metabol 模块中） salvage_secondary_labels()（在 omicverse.space 模块中） sample_qc()（在 omicverse.metabol 模块中） sample_qc_plot()（在 omicverse.metabol 模块中） save()（在 omicverse.io 模块中） sc_ref_Lymph_Node()（在 omicverse.datasets 模块中） scale()（在 omicverse.pp 模块中） scanpy_cellanno_from_dict()（在 omicverse.single 模块中） SCENIC（omicverse.single 中的类） sceu_seq_organoid()（在 omicverse.datasets 模块中） sceu_seq_rpe1()（在 omicverse.datasets 模块中） scifate()（在 omicverse.datasets 模块中） scnt_seq_neuron_labeling()（在 omicverse.datasets 模块中） scnt_seq_neuron_splicing()（在 omicverse.datasets 模块中） score_genes_cell_cycle()（在 omicverse.pp 模块中） scrublet()（在 omicverse.pp 模块中） scrublet_simulate_doublets()（在 omicverse.pp 模块中） scslamseq()（在 omicverse.datasets 模块中） search_clinical_trials()（在 omicverse.utils.biocontext 模块中） search_drugs()（在 omicverse.utils.biocontext 模块中） search_interpro()（在 omicverse.utils.biocontext 模块中） search_literature()（在 omicverse.utils.biocontext 模块中） search_preprints()（在 omicverse.utils.biocontext 模块中） search_pride()（在 omicverse.utils.biocontext 模块中） select_hvf_pegasus()（在 omicverse.pp 模块中） seqfish()（在 omicverse.datasets 模块中） serrf()（在 omicverse.metabol 模块中） simulate_paired()（在 omicverse.micro 模块中） Single2Spatial（omicverse.bulk2single 中的类） single_group_boxplot()（在 omicverse.pl 模块中） spatial_autocorr()（在 omicverse.space 模块中） spatial_neighbors()（在 omicverse.space 模块中） stacking_vol()（在 omicverse.pl 模块中） STAR()（在 omicverse.alignment 模块中） store_layers()（在 omicverse.utils 模块中） string_interaction()（在 omicverse.bulk 模块中） STT（omicverse.space 中的类） sude()（在 omicverse.pp 模块中） svg()（在 omicverse.space 模块中） symbol2id()（在 omicverse.utils 模块中） sync_visium_hd_seg_geometries()（在 omicverse.space 模块中） T Tangram（omicverse.space 中的类） toggleswitch()（在 omicverse.datasets 模块中） TrajInfer（omicverse.single 中的类） transform()（在 omicverse.metabol 模块中） tsne()（在 omicverse.pl 模块中） tsne()（在 omicverse.pp 模块中） U umap()（在 omicverse.pl 模块中） umap()（在 omicverse.pp 模块中） update_classification_from_database()（在 omicverse.space 模块中） V Velo（omicverse.single 中的类） venn()（在 omicverse.pl 模块中） violin()（在 omicverse.pl 模块中） vip_bar()（在 omicverse.metabol 模块中） visium_10x_hd_cellpose_expand()（在 omicverse.space 模块中） visium_10x_hd_cellpose_gex()（在 omicverse.space 模块中） visium_10x_hd_cellpose_he()（在 omicverse.space 模块中） volcano()（在 omicverse.metabol 模块中） volcano()（在 omicverse.pl 模块中） W weighted_knn_trainer()（在 omicverse.utils 模块中） weighted_knn_transfer()（在 omicverse.utils 模块中） wrap_dataframe()（在 omicverse.utils 模块中） Z zebrafish()（在 omicverse.datasets 模块中）
