单独的注释方法#
下面这些教程分别针对一个注释 backend 直接调其低层入口，不走
ov.single.Annotation 统一接口。适合需要对某一方法做精细调参，或者
希望在相同输入上对比每个 backend 表现的场景。
- 使用 SCSA 进行细胞类型自动注释
- Automatic cell type annotation with GPT/Other
- 使用 MetaTiME 的细胞类型自动注释
- Using scMulan to annotate cell types in Heart, Lung, Liver, Bone marrow, Blood, Brain, and Thymus
- 1. load h5ad
- 2. transform original h5ad with uniformed genes (42117 genes)
- 3. process uniformed data (simply norm and log1p)
- 4. load scMulan
- 5. visualization
- Celltype annotation migration(mapping) with TOSICA
推荐的统一工作流入口：