# Bulk RNA-seq

涵盖上游比对、预处理、差异表达、网络分析、去卷积和 TCGA 工作流的教程。

## 上游

```{toctree}
:maxdepth: 1

../Tutorials-bulk/t_mapping_STAR
../Tutorials-bulk/t_mapping_kbpython
```

## 预处理

```{toctree}
:maxdepth: 1

../Tutorials-bulk/t_bulk_combat
```

## 下游

```{toctree}
:maxdepth: 1

../Tutorials-bulk/t_deg
../Tutorials-bulk/t_deseq2
../Tutorials-bulk/t_network
../Tutorials-bulk/t_wgcna
```

## 去卷积

```{toctree}
:maxdepth: 1

../Tutorials-bulk/t_decov_bulk
```

## 其他

```{toctree}
:maxdepth: 1

../Tutorials-bulk/t_tcga
```